臨高南站位于西線高速博厚互通附近，車站緊鄰臨海路東側(cè)約500m處設(shè)置，為本線中間站。車站中心里程K52+131.140，北距福山鎮(zhèn)站16.8km，南距銀灘站29.7km，車站設(shè)到發(fā)線4條，按“兩臺夾4線”布置，車站三亞端設(shè)綜合維修車間1座。設(shè)旅客進、出站地道一座，有站臺柱鋼筋混凝土雨棚。為線側(cè)平式站房，站房總建筑面積4000m2。
臨高南站站房采用三組坡屋頂山巒疊峰，空間層次豐富，細膩優(yōu)美，并在建筑細節(jié)處融入當?shù)貍鹘y(tǒng)建筑元素，體現(xiàn)了臨高“全國民間藝術(shù)之鄉(xiāng)“的特點。站房為鋼筋混凝土框架結(jié)構(gòu)，基礎(chǔ)形式為獨立基礎(chǔ)。